Nainggolan menghabiskan tiga musim di Giuseppe Meazza, di mana pada musim terakhirnya hubunganna dengan Conte memburuk.

“Conte adalah pelatih top, tetapi saya tidak memiliki kesempatan (bermain) dengannya,” ujar Nainggolan.

“Kami tidak pernah berdebat tetapi orang lain yang memberi tahu saya bahwa saya harus pergi. Saya lebih suka orang yang mengatakan sesuatu di depan saya.”

Jika di AS Roma Nainggolan merasa bahagia,  maka di Inter serasa bagai neraka. Dia mengalami awal musim yang buruk dan hanya mencatat 6 gol dalam 33 penampilan di semua kompetisi.

Dia akhirnya dipinjamkan ke Cagliari selama dua musim sebelum kemudian memutuskang pulang kampung dan bermain di Royal Antwerp.