Mario Gomez juga memiliki satu keinginan yang belum tercapai. Keinginan itu yakni menjadi pelatih tim nasional. Gomez hampir menjadi pelatih Timnas Malaysia, setelah Ong Kim Swee diturunkan dari kursi pelatih timnas senior pada awal 2017 usai menangani Johor Darul Takzim.

Namun ia harus menunda impiannya karena ketidaksepakatan antara Mario Gomez dengan FAM atau PSSI-nya Malaysia.

"Saya telah menjuarai piala di Asia dan merasakan Liga Champions dan Liga Europa, di mana keduanya sebagai asisten Hector Cuper di Valencia dan Inter. Setelah gagal memiliki kesempatan di Malaysia, saya ingin menjadi pelatih tim nasional. Dan kemudian kembali ke Argentina," tandasnya.