Sepakbola sudah masuk ke wilayah Timor Leste semenjak negara tersebut masih berada dalam jajahan koloni bangsa Portugis. Usai masa penjajahan berakhir selama 20 tahun, dan Timor Leste menjadi milik Indonesia, perkembangan sepakbola di sana nyatanya belum mampu berkembang dengan baik.

Maklum saja, kala itu penduduk Timor Leste lebih disibukkan untuk memikirkan bagaimana kelanjutan hidup mereka ketimbang menggocek si kulit bundar. Hingga pada akhirnya Timor Leste melepaskan diri dari Indonesia pada 2000.

Asosiasi Sepakbola Timor Leste diterima sebagai anggota asosiasi dari Federasi Sepakbola Asia (AFC) pada Kongres AFC ke-20 pada 2002. Debut internasional mereka terjadi pada Maret 2003 ketika ikut serta dalam babak kualifikasi Piala Asia AFC 2004 China.

Mereka masuk ke dalam kompetisi regional untuk pertama kalinya pada tahun 2004 saat mereka bermain di AFF Suzuki Cup (sebelumnya dikenal sebagai Piala Tiger) sebagai anggota yang diundang. Berbeda dengan sepakbola Indonesia yang bahkan sudah eksis mengkuti Piala Dunia pada 1938 saat masih dijajah Belanda dan masih menggunakan nama negara Hindia Belanda.